HPV疫苗的第一针和第二针都需要严格按照时间进行注射，因为按照时间严格注射的情况下，疫苗能够达到最大的保护力。如果注射第二针的时间有所偏移，差的不是很多的情况下通常影响也不会太大。目前HPV疫苗分为2价、4价和9价疫苗，2价注射的时间是0月、1月和6月，而4价和9价注射的时间是0月、2月和6月。之所以做出此类设计以及需要注射两针，主要是以此可以提供最大的保护力。在HPV疫苗注射第一针之后，人体体内会产生一定量的抗体，而抗体在初期随着时间的延长逐渐增多，到一定程度之后到达峰值，在峰值之后逐渐降低。

如果单纯一支注射，可能在时间比较长以后保护力便有所下降，所以在适度的时间注射第二支，可以使体内的抗体的水平进一步增加。因此第二种时间的选择很重要，在第一针产生的抗体减弱之前打上第二针，能产生最大的保护力。如果第二针的时间有所偏移，改变不是特别多的情况下总体影响不会太大，但如果时间相差太多便有可能达不到最佳的预防效果。