贲门癌可于胃镜下进行观察，胃镜是诊断和确诊贲门癌非常有效的方法，也是临床上经常用到的检查方法。在胃镜下贲门癌早期只是发生在贲门部，即食管与胃的结合部，黏膜只是存在红斑或黏膜呈糜烂、颗粒状，或者存在小的结节改变。

随着贲门癌的发展，这些表现会进而向着黏膜或者黏膜下层浸润，进而形成中晚期的表现，会形成菜花状的新生物或者形成恶性的深溃疡状的新生物。

随着疾病的再发展，贲门癌还可以向上侵犯至食管下端，向下侵犯到贲门下，或者侵犯到胃体，此外还可以随着疾病的发展侵犯到胃角，进而影响整个胃。