肺功能检查和胸部CT没有可比性，因为二者检查的项目不同。胸部CT反映的是肺内结构的问题，类似于查看汽车里面的发动机以及各个部分零件是否齐全，所以只是反映肺内有无病变，肺结构有无异常的情况。而肺功能检查则是检测肺的功能，类似于车所有部件都完整、齐全，而车的性能不同，所以每个人的肺结构可能都是正常的状态，但是做肺功能检查时差异较大，根据性别、年龄、身高、体重，本身存在生理差异性。
此外，在诊断疾病的方面也各不同，胸部CT可以检查肺部感染、肺间质有无病变，以及有无肿瘤、结核等疾病。而肺功能检查主要明确患者有无慢阻肺、哮喘等疾病。
