肝移植是移植其他人体的完整器官，人体有组织相容性抗原和其它抗原，对于不是自己的任何组织，如细菌、细胞都有排斥反应，输血其实也有一定的排斥反应，如果ABO血型相符，排斥反应低，在可接受范围之内。
如果不予控制排斥反应，移植完整器官会引起严重的排异反应。随着现代各种抗排异药物的发明和发展，现在肝移植术后排异基本已经解决，所以现在肝移植术后长期生存20年、30年甚至40年的病例存在，所以移植反应已经完全解决。但是需要注意，抗排异药不够停，一旦停用抗排异药物同样会出现严重的排异反应，所以肝移植术后终身服用。