肛周脓肿常见临床原因为肛门腺感染。肛门腺即肛门内部，大概距肛缘2cm左右的地方具有分泌黏液功能的腺体，类似于唾液腺，其功能为分泌黏液，润滑大便，保证大便顺利排出。腺体一旦发生感染，将蔓延至肛门或直肠周围，形成化脓性感染，即脓肿，称为肛周脓肿。非腺源性感染，为引起脓肿的少见原因，比如异物刺伤或继发于其它肛门疾病损伤，如某些手术后感染、肿瘤感染、特异性感染，比如结核菌感染等，均可引起肛周脓肿。
肛周脓肿临床上治疗，需进行外科干预，及时就诊。故肛周脓肿患者不可犹豫、在家观望或自行应用抗生素治疗，以免引起疾病的加重，导致治疗延误，给治疗带来困难，拖延久后肛周脓肿可能发展成肛瘘，对疾病治疗也有一定的风险。