小腿骨折后肌肉萎缩的治疗，首先是需要进行功能性锻炼，比如主动活动方面，通过患者进行踝关节屈伸运动，可以让小腿肌肉得到相应的锻炼。

另外，还有理疗或者是康复训练，同时亦可以进行机器训练，包括主动屈伸、抗阻屈伸活动，或者是让病人站位进行跟部提起，此种运动会锻炼后侧的小腿三头肌。另外，中医针灸、推拿、中药熏洗，包括一些理疗等，均可针对小腿肌肉萎缩进行治疗。