百部较常用在肺部疾病，因为具有较好的润肺止咳效果，无论是外感内伤、新病久病，还是各种原因引起的咳嗽都可以用百部进行治疗。百部润肺作用在所有中药里都有代表性，比较百搭，和其它各种药物配合都可以使用。比如虚证时可以和补气的药一起用，如果是痰湿可以和化痰的药一起用，各种引起肺部咳嗽和肺燥的疾病都可以加入百部。现代药理学研究发现百部具有生物碱类的作用，可以降低呼吸中枢的兴奋性，所以可以达到止咳效果，在临床上也经常可以验证到这一点。

百部还有杀虫灭虱的功效，现在应用较少，过去应用较多，因为过去各种虫害和虱子比较多，现在药理研究发现百部对多种细菌有抑制作用，所以对虫虱本身也有杀灭作用。如果出现肺部或其它疾病感染，比如结核菌等其它细菌，此时也可以用百部起到杀菌作用，百部大多和其它药物一起在汤药中使用，很少单独使用。