脂肪瘤手术时间与脂肪瘤具体部位，以及生物学特性有较大关系，腹部或肢体脂肪瘤手术较易进行，甚至较大脂肪瘤手术时间大多不会超过半小时。手术前应进行超声等影像学检查，可判断大多数脂肪瘤性质。

后背等皮肤较厚、肌肉较发达部位脂肪瘤称为纤维脂肪瘤，弹力纤维瘤易使脂肪组织与肌肉组织形成交叉、粘连，手术相对困难。尤其肩胛处脂肪瘤常可钻到肩胛骨下，与周围肌肉组织交织导致较难完整切除，手术时间可明显延长，疼痛感也会加重。