真菌性毛囊炎可以采用口服、外用，或口服加外用的方法进行治疗，以取得好的效果。真菌性毛囊炎一般指马拉色菌感染的毛囊炎，马拉色菌是一种酵母菌，一般在夏季出汗时容易多发，好发于胸部、背部，因为这些位置皮脂腺比较多，分布比较旺盛。

针对真菌性毛囊炎，外用抗真菌药主要是酮康唑、联苯苄唑、特比萘芬、利拉萘酯、硫康唑等，这些抗真菌药物都可以抑制马拉色菌的生长，可以达到杀灭马拉色菌的效果。口服药物主要是伊曲康唑和氟康唑，口服后通过血液循环到达毛囊皮脂腺的位置，同样可以抑制马拉色菌的生长。