引起小孩矮小症原因较多，包括遗传因素、疾病因素、营养因素、体质因素以及社会心理问题等，需明确诊断、对症治疗。具体如下：

1、遗传因素，如家族性特发性矮小症；

2、营养因素，如蛋白质、热量、维生素、微量元素摄入不足；

3、内分泌疾病，如生长激素缺乏症、性早熟、儿童1型糖尿病、先天性卵巢发育不良、迟发性甲状腺功能低等疾病；

4、各种慢性全身性疾病如先天性心脏病、哮喘、炎症性肠病等；

5、母亲怀孕时胎盘功能异常或营养不良，会引起胎儿宫内发育迟缓，儿童出生以后也会引起矮小症；

6、社会心理性矮小，儿童生长过程中精神、心理受到严重创伤，如受过歧视、虐待导致。