乙肝的最关键的治疗是抗病毒治疗。目前在国内有药物干扰素治疗，有短效和长效。国家先后在90年代初期上市拉米夫定，后来有阿德福韦酯、恩替卡韦、替比夫定、替诺福韦，现在还有富马酸丙酚替诺福韦先后上市。

全国感染界已经明确的经过多年的研究得出结论，推荐的一线用药有恩替卡韦、替诺福韦和富马酸丙酚替诺福韦。国家“4+7”执行以后，恩替卡韦和替诺福韦都非常便宜，所以目前抗病毒治疗，主要用干扰素或者核苷类，由医生指导下进行规范使用。