髓母细胞瘤属于胚胎性肿瘤，是胚胎细胞残余发展而来，所以最常见部位起源于小脑后髓帆，最关键部位在小脑蚓部。随着肿瘤长大，可能会出现偏侧性生长，即向左或者向右增长，甚至长出第四脑室。因为肿瘤生长，趋向性是哪里空间大、压力小，其就往哪里长，所以会出现偏侧症状，一侧多一侧少。

髓母细胞瘤的部位主要是小脑蚓，但有时也会出现偏侧，在小脑蚓部长出以后，往左侧或者右侧小脑半球发展，甚至有时可以看到其纯粹在小脑半球出现，但这种很少见。最常见的部位是在小脑蚓部，但因为髓母细胞瘤是以胚胎性肿瘤存在，所以其起源于后髓帆的残余组织。