碱性磷酸酶正常范围通常为40-150U/L，当碱性磷酸酶出现异常时，可反映出骨骼系统、肝胆系统出现一系列异常。当该值升高时可通过一系列检查发现出现问题的具体系统，可进行骨扫描或肝脏功能检查。如果为肝脏功能出现异常，则碱性磷酸酶可表现为高值，其他如谷丙转氨酶、谷草转氨酶或胆红素、白蛋白等也可能出现一系列数值改变。

通常病毒性肝炎、酒精或药物肝损害，以及梗阻性黄疸均可出现肝功能损害，此时可针对病因进行治疗。患者可进行抗病毒、戒酒，及停止使用肝脏功能损伤药物，或采取外科手段切除结石或肿瘤，保证胆道引流通畅。通过一系列治疗肝功能可得到恢复，包括碱性磷酸酶在内的酶学指标，也可恢复到正常范围。