鼻窦囊肿患者只能通过手术干预，一般在内镜下操作。内镜下操作会非常清晰定位到囊肿，尤其适用于黏液囊肿，黏液囊肿常见于筛窦、额窦，黏液囊肿对患者的生活影响最大，最容易出现颅眶并发症、失明。

通过手术干预能够迅速定位囊肿，将囊肿打孔，临床称皂甙化，皂甙化后将囊性分泌物引流，囊壁黏膜可跟鼻腔黏膜共同生长成为正常黏膜。

手术创伤非常小，恢复非常快，术后病人临床症状很快得到改善，所以有人提出内镜手术最适合的疾病是鼻窦囊肿。如果有鼻窦囊肿，通过合理手术、精准定位，能够很好将疾病去除。如上颌窦黏膜囊肿的特殊囊肿，对生活影响不大，但由于较深在，且在上颌窦底壁或外侧或前壁，处理相对麻烦，但同样有有效治疗方法。

鼻窦囊肿会引起一系列临床症状，患者可以出现鼻塞，影响眼睛时会出现眼球突出、面颊突出，还会出现复视，甚至出现上睑下垂、眼肌运动障碍、失明，囊肿会破坏颅底骨头，患者会出现脑脊液鼻漏。