一般查脑血栓，首选检查颅脑CT或磁共振，这两种检查各有优势。颅脑CT方便快捷，入院后随到随做，但发生脑梗塞通常24小时显影。颅脑磁共振对早期的脑血栓比较敏感，能及时发现脑梗塞的发生。临床上首选CT检查的原因是CT对脑出血的敏感性高，如果患者考虑为脑血管病，进行CT检查排除出血后，肯定就是脑血栓形成，可以制定治疗方案。

下一步需检查脑血栓的危险因素。第一是物理检查，如观察患者血压情况，检查有无血管听诊区的杂音；第二是化验检查，包括血脂、血糖、同型半胱氨酸、血栓相关指标；第三是血管超声，如颈动脉彩超、经颅多普勒，检查有无脑动脉狭窄和脑血流速度的改变等。