新生儿房扑的原因有很多种，具体如下：

1、心脏本身有问题：临床最常见的就是新生儿心脏本身有问题，比如常见的心脏的结构性病变，比如有房缺、室缺、三尖瓣发育异常或肺动脉高压等，这样可以导致左右心房结构变化，从而容易产生新生儿房扑；

2、心肌本身的病变：临床上多见的，比如心肌病也会造成心脏结构异常，甚至心脏的电活动异常，从而容易导致新生儿房扑的发生；

3、电解质紊乱：临床常见的就是电解质紊乱，比如由于呕吐、腹泻、感染等情况，或者是用药不当，造成体内电解质紊乱，也会造成新生儿房扑的发生；

4、药物：可能由于应用某些不恰当的药物，造成心脏本身电活动异常，也会导致新生儿房扑的发生。

但是临床上最常见的原因就是新生儿本身心脏结构的异常，双房的增大，这是产生新生儿房扑最主要的原因。因为心脏大才容易引起电活动在心房内折返，从而导致新生儿房扑的发生。