育龄妇女有一种常见的妇科疾病叫子宫内膜异位症。子宫内膜正常应该存在于子宫腔里，随着月经发生发展，子宫内膜会每个月脱落一次，脱落经过宫颈从阴道排出经血。月经的发生过程中，有一部分经血可能会顺输卵管逆流到盆腔，主要部位可能在卵巢部位。
异位内膜主要在卵巢上扎根生长，随每一次月经长大，经过一段时间的发展可长出肿物，其内包含月经血。由于储存时间长，月经血的颜色变成咖啡色，时间越长越浓稠，类似巧克力样，所以叫卵巢巧克力囊肿。
从解剖上囊肿可为单侧或双侧，囊肿越长越大对卵巢组织有压迫、侵蚀，造成卵巢功能改变。囊肿绝大多数是良性，但是如果细胞生长过度，会发生恶性改变，但概率很低约1%。育龄妇女中这种疾病并不少见，能达到10%-20%的比例，而且有痛经症状的病人中发生率更高。