太阳穴跳着疼，可以是各种原发性头痛和继发性头痛造成。原发性头痛主要是因为偏头痛的发作，会引起太阳穴跳着疼，主要是血管性头痛造成。还有丛集性头痛，也会出现太阳穴跳着疼，是三叉神经的自主神经功能障碍造成。
还有就是紧张型头痛，也会出现肌肉收缩，而出现太阳穴跳着疼的症状，因为精神紧张，造成肌肉收缩。继发性头痛，也可能造成太阳穴跳着疼，主要有因为鼻窦炎刺激，造成太阳穴跳着疼。额窦炎症，还有青光眼眼压升高，会引起太阳穴跳着疼。
颞动脉炎，也就是一种血管炎，会出现太阳穴跳着疼的症状。以及各种原因引起的病毒感染，也会出现太阳穴跳着疼，最常见的病毒是带状疱疹病毒；
还有一部分原因可能是存在血管性因素，或者非血管性因素，造成颅内压增高，或者神经血管牵拉，如脑积水、脑炎、脑肿瘤、脑梗、脑出血，都会出现太阳穴跳着疼的症状，血压波动也会表现出太阳穴跳着疼的症状。
