两侧太阳穴痛，根据病因，还有根据疼痛的性质不同，可能病因会不一样，治疗也会不一样。

1、偏头痛：首先如果表现为双侧太阳穴搏动样疼痛或者跳痛，首先考虑是因为偏头痛引起；

2、神经痛：如果是针刺样的头痛，考虑是病毒感染引起的神经痛；

3、紧张性头痛或者神经性头痛：如果表现为双侧的胀痛，一般考虑是紧张性头痛或者神经性头痛引起；

4、丛集性头痛：还有一种就是心钻样的、钻孔样的疼痛，非常严重的疼痛，可能考虑是丛集性头痛引起；

5、颅内压高压：如果头痛，同时伴有恶心、呕吐的症状，比较严重的，还有视乳头水肿，这种情况要考虑是因为颅内压高压引起；

6、青光眼：还有就是一些就是相关的疾病，如眼睛的疾病，包括青光眼，眼压增高引起的，也会引起双侧的疼痛症状，这种要针对青光眼进行治疗；

7、鼻窦炎：特别是额窦的地方出现炎症，会出现双侧太阳穴疼痛的症状。这种情况要给予治疗鼻窦炎手术，或者抗感染的治疗，可以改善双侧太阳穴疼痛的症状。

根据疼痛的性质不同，不同的病因，可以给予相应不同的治疗改善。