性功能障碍在一定程度上会影响怀孕，如果夫妻双方的生殖器官能够产生正常质量的精子和卵子，则在一定程度上不影响怀孕。但是如果性功能障碍导致双方的性满意度较差，在一定程度上很难使精子到达卵子的周围，则较难怀孕。
但是通过规范的治疗后可以怀孕，如果是严重的性功能障碍，治疗周期比较长，又考虑到女方年龄比较大的情况下，还可以采取辅助生殖技术的方法，比如人工授精、试管婴儿等方法，使精子和卵子结合起来，达到活跃的目的。
所以，性功能障碍的患者不要担心，通过规范的治疗，能够自然怀孕是上策，即使不能够正常的自然怀孕，通过现在的辅助生殖技术，很多严重的性功能障碍患者也可以怀孕。
