由于矮小症原因比较复杂，因此在治疗上要结合孩子的实际情况进行分析，根据病因辅以相关检查，进行药物、心理以及原发病治疗，具体如下：

1、原发病治疗，如果孩子主要由于脑外伤或者放疗、肿瘤等引起继发性生长激素缺乏，需要外科手术治疗，再联合生长激素等干预治疗。如果是精神心理因素、肾小管酸中毒以及生活习惯等引起矮小症，在相关因素被消除以后，身高增长才会改善。因此医生建议孩子改善生活方式，比如保证睡眠、平衡膳食，多做纵向和耐力的运动；

2、对患儿需要进行心理辅导，大多数矮小症患儿可能会存在孤独、自卑，不愿意与人交往，甚至抑郁或者消极状态，不利于身高增长。因此作为家长、老师或者医生，应该注意观察孩子心理活动，对孩子进行必要疏导、关心，帮助孩子建立对矮小症的正确认识，保证良好心态；

3、医生需要根据病因进行相关药物治疗，比如病人甲状腺功能低下，需要用左旋甲状腺素钠片替代治疗。如果是生长激素缺乏，可以用重组人生长激素、生长激素释放激素进行替代治疗。如果是由于性激素导致，存在性发育成熟异常，可以酌情使用亮丙瑞林或者曲普瑞林等抑制性发育药物进行干预治疗。