飞机上耳朵疼的原因，通常考虑为气压伤。鼓膜位于正常位置时，鼓室内和外界大气压平衡，但患者在飞机上，尤其飞机降落时，鼓室内无法得到有效换气时，鼓室和外界形成气压差，导致鼓膜偏离正常位置，轻则鼓膜疼，重则鼓膜充血，甚至破裂。
咽喉管是维持中耳正常气压结构，一般处于关闭状态，耳朵可通过咽鼓管，在中耳以及鼻咽部进行气体交换。在说话、吞咽、咀嚼，尤其打哈欠时，咽鼓管可以短暂开放，维持中耳正常气压。但在鼻炎，特别是肥厚性鼻炎，鼻窦炎，或者鼻咽部良恶性肿瘤、腺样体肥大时，均可影响咽鼓管开放，从而影响中耳气压的平衡。尤其咽鼓管功能不良的患者，坐飞机容易耳疼，一般建议多喝水、打哈欠，或者做捏鼻鼓气的动作，缓解耳部疼痛。
