疱疹性咽峡炎后期一般不会咳嗽。疱疹性咽峡炎是一种柯萨奇病毒或者EV71病毒引起的咽峡部炎症，主要表现为发烧，个别患者会有轻微咳嗽，如果合并支气管炎或者甚至合并肺炎，咳嗽较重。所以疱疹性咽峡炎不一定都会咳嗽，咳嗽也不要紧张。

如果不发烧，对症治疗即可，用一些止咳化痰的药。如果咳嗽较重，可以用雾化的药物，包括布地奈德、特布他林。另外可以用中药，包括开喉剑。其它也可以用一些干扰素或者利巴韦林，都可以雾化吸入来治疗咽峡炎后期的咳嗽，效果比较明显，预后较好。