小儿支原体感染的症状分为全身的症状和局部的症状两个方面。全身症状包括发热、精神差、食欲不振，局部症状包括咳嗽、呼吸异常、呼吸困难。

支原体感染的症状为多样性，有轻有重，咳嗽持续时间可以较长，也可以较短。症状轻可以表现为支气管炎，研究发现支原体感染可以引起上呼吸道感染的症状，不一定会发展成肺炎，重者可能有全身多系统损害，包括血小板减少，甚至血栓形成。最常见的症状是肺炎，严重者甚至引起重症性肺炎、坏死性肺炎。支原体的特点是没有细胞壁，比病毒大，比细菌小，所以多数在病毒感染的基础上合并支原体感染。