对于新鲜的肛裂，即急性肛裂，相当一部分患者可以自愈，通常需要7-10天的时间。这种由于排便或者排便力量过大等，造成肛管上皮组织破裂，创伤可能会得到修复，但也有相当一部分急性肛裂会转变为慢性肛裂。临床上大部分就诊的肛裂患者，均为慢性肛裂，主要是由急性肛裂转变转化而来。慢性肛裂很难自愈，如果不经过治疗措施，自愈的可能性较低。目前药物治疗现有的资料显示，具有40%作用的治愈率，其他仍需要手术治疗。现有研究表面，即使是有40%的治疗痊愈率，其结果也仍有待观察。

对于肛裂患者真正的治愈，是指1年内不再发作。相当一部分患者为间断发作的状态，而反复出现肛门疼痛、手纸带血的症状，疼痛可能持续1-2周即可缓解，也可能肛裂、溃疡会得到假性愈合，但会反复发作。因此这种状态的肛裂，并非痊愈，而是暂时出现静止状态。因此对于慢性肛裂，大部分患者可能需要手术治疗，而药物治疗的疗效有待进一步研究。