卵巢囊肿使用阴超能够检查出来，而且对于卵巢囊肿而言，B超更容易查出。因为囊肿囊内是液性暗区，与周围的组织器官能够形成鲜明的对比，所以在超声的识别上更为容易。

阴道超声比腹部超声主要的优点，是对部分小病灶更敏感，即阴道超声更易发现小的病灶，所以目前临床上基本上都是做阴道超声。同时患者进行阴道超声不需要憋尿，不必到门诊以后等待较长时间。但是阴道超声的缺点，是不能在月经期间进行，因为在月经期间有出血的情况下，做阴道超声较易出现感染。