目前根除幽门螺杆菌的首选治疗方案推荐是含有铋剂的四联疗法，一种强效抑酸药加铋剂还有两种抗生素，抑酸药如埃索美拉唑、兰索拉唑、艾普拉唑、雷贝拉唑等，铋剂如枸橼酸铋钾、果胶铋等，抗生素目前推荐的是阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑、左氧氟沙星、四环素、呋喃唑酮。甲硝唑和克拉霉素近几年耐药率在逐年增高，所以在选择治疗方面要避免这两个药物同时选择使用。
左氧氟沙星是作为二线或补救治疗方案用药，或对阿莫西林过敏的人群选择使用，虽然上述根除治疗的成功率可以达到80%以上，但由于耐药率增高，仍然有部分患者根除不能成功。