蛛网膜囊肿多数并不会造成严重影响，因为脑存在一定的空间区域。但如果蛛网膜囊肿比较大的时候，不可避免地会压迫相应的脑功能区。例如位于后颅窝的蛛网膜囊肿将会压迫小脑和脑干，小脑是与肢体协调运动、肌张力、平衡能力等相关的重要结构。如果蛛网膜囊肿压迫小脑，患者可能会出现共济失调、平衡障碍，表现为指鼻试验不稳定，或者走路歪斜、东倒西歪，有时造成肌张力障碍，肌张力会出现过强、过大，从而导致肢体功能的不协调。如果蛛网膜囊肿比较严重，不仅压迫小脑，同时会压迫到深处，造成小脑和脑干一起受压，严重者会造成脑疝。
所以如果发生蛛网膜囊肿，应积极诊断，明确判断是否需要进行外科干预。
