引起咽喉痛伴头痛的原因主要有以下几种：

1、急性原因：最常见的是上呼吸道病毒性感染即感冒，可能伴有急性咽炎、急性鼻炎、急性鼻窦炎的发作。急性咽炎可表现为咽喉部疼痛、干燥等不适，而急性鼻炎和鼻窦炎，均可影响鼻腔通气，从而引起缺氧性头痛。甚至急性鼻窦炎产生的分泌物，可以直接刺激中枢黏膜，引起神经反射而导致头痛；

2、慢性原因：如长期慢性鼻窦炎，可引起长期、慢性的头痛。尤其是鼻后滴漏综合征的患者，脓性分泌物倒流入咽喉部，也可引起咽喉部疼痛。

咽喉痛伴有头痛常见于感冒，也可以由鼻部疾患引发，同时引发下游的咽喉痛，所以出现此类症状应及时到耳鼻喉科就诊。