胃肠道间质瘤的发病率很低，在国际上属于罕见病，约占胃肠道恶性肿瘤的1%-3%，全球发病率在1/10万-1.5/10万，我国每年有2-3万人新发，总共约有超过10万人正在接受治疗。

胃肠道间质瘤多见于中老年患者，男女比例没有显著差异，可以发生在消化道的任何部位，最常见的是发生在胃，其比例为60%-65%，其次是小肠，发病比例为20%-25%，另外还包括直肠、结肠、食管和其他部位都可能发生。虽然被称为胃肠道间质瘤，但并不是胃肠道以外就不能发生，只是发生率比较低，肿瘤可以发现于大网膜、肠系膜、腹膜后、胆囊和胰腺。

由于胃肠道间质瘤的病情进展通常比较慢，且早期的临床症状不典型，患者通常在体检、做胃镜或者CT检查时偶然发现。此时进行手术切除，一般能够取得最佳治疗效果。手术切除以后，根据病理情况，明确是否需要进一步行靶向药物辅助治疗，以降低患者术后复发、转移的概率。