肝内胆管结石治疗分为两类，具体如下：

一、无需干预：肝内只有散在一个或多个小结石，通常结石＜1cm，不会诱发症状，都是在体检过程中发现，发病因素并不清楚，可能与局部感染或胆管发育有关，以观察为主。如果出现症状，可以考虑口服利胆药物；

二、需要干预：1、某片区域肝脏组织内充满结石，如左外叶肝内胆管结石最常见，肝脏可能出现萎缩，需要切除结石部位。2、肝内主干结石较大、较多，需要在肝脏和体表间建立隧道，通过隧道反复取结石治疗。