扁桃体位于腭舌弓和腭咽弓之间，悬雍垂是它的中线，正常的扁桃体在张嘴，发出"啊"声时，可看到其外覆一层被膜，放大后可看到很多隐窝，为淋巴组织，隐窝的黏膜有分泌功能，它有腺体细胞，有时分泌后直接进入口腔，还有一些可能存留在隐窝里，在漱口或吃东西、咽口水时，分泌物进行循环。

如果扁桃体发炎，为单纯化脓性扁桃体炎，可分泌一些脓性分泌物，附在表面，分泌物可以随着炎症消失而减少。扁桃体位于悬雍垂旁的两侧，一般分成3度，超过中线是Ⅲ度，超过腭咽弓为Ⅱ度，在腭咽弓和腭舌弓之间为Ⅰ度。