病理学上，根据恶性肿瘤的分化程度，细胞异型性，细胞核分裂象，分裂象数目对恶性肿瘤进行分级，通常低级代表分化较好，恶性程度较低，高级代表分化差恶性程度高。恶性胸腺瘤在胸腺病理学上，病理分型分为A、AB、B1、B2、B3、C，而低度恶性胸腺瘤处于A或者AB型。

除胸腺瘤病理分型之外，临床上常用Masaoka分期，即肿瘤生长程度，根据胸腺瘤有没有包膜，包膜有没有侵犯，有没有远处转移分为MasaokaⅠ期、Ⅱ期、Ⅲ期、Ⅳ期。Masaoka分期属于Ⅰ期的胸腺瘤，WH病理分型属于A型，这类胸腺瘤手术治疗后有较好的5年和10年生存率。患者术后复发概率低，不建议患者术后进行辅助放疗或者化疗。患者有良好的5年生存率，与正常人没有较大的区别，因此这类Ⅰ期分期较早，分型较好的胸腺瘤，称为低度恶性胸腺瘤，这类胸腺瘤患者术后只要进行定期随访即可。