肠镜下切除是肠息肉的最主要治疗手段之一，也是最有效、最安全。肠镜下切除具有微创性、重复性切除等特点，对功能的保留最完整，所以肠息肉一经发现，均会建议在肠镜下切除。息肉分为带蒂和广基息肉，尤其带蒂息肉，即使是早癌或高级别上皮内瘤变，息肉的蒂没有腺体，很少被癌浸润累及，所以有蒂的息肉最适合在肠镜下切除，把蒂彻底切断，肠息肉就可以完整切除。
对于广基型息肉，通过肠镜下黏膜切除(EMR)和肠镜下黏膜下切除(ESD)，也可以达到完整切除的目标，且通过病理的详细检查发现基底切缘有无癌的累及。即使肠息肉有癌变，只要癌细胞尚未浸润到肌层，也可以在肠镜下切除。
