扁桃体化脓后患者要进行消炎处理，如使用洗必泰漱口液1天漱3-4次或4-5次，同时应用抗生素。如果化脓症状较轻，可以选择口服抗生素，如头孢克肟胶囊、阿莫西林颗粒、青霉素V钾片等，但前提是患者对上述药物不过敏。
如果患者对上述药物存在过敏史，则需选择阿奇霉素片、红霉素片、罗红霉素胶囊、盐酸林可霉素片、氧氟沙星片等，上述药物的过敏可能性较小。
此外，患者还可应用中成药，如新癀片、蓝芩口服液、双黄连口服液等，中西药合用可能效果会更好。通常还建议局部应用桂林西瓜霜含片、银黄含片等，均可起到局部消炎的作用。
患者在用药时还要注意观察症状是否有缓解，如果没有缓解则可改用输液治疗，主要是抗生素，而中成药依旧需要口服或含服。
如果输液后症状不见好转，则需明确是否存在扁桃体周围炎症或脓肿。此类患者可能会出现吞咽疼痛或呼吸不畅等情况，建议及时检查、及时处理。
