儿童尿路感染推荐使用头孢类抗生素，代表性的药物有头孢克洛、头孢地尼、头孢曲松钠，因为头孢类的抗生素一般毒副作用较小。
用药重点考虑孩子是否有相应的头孢类药物过敏史，如果没有，可以按照药物说明书，按照孩子的体重来给药，一般治疗3-5天，再次复查尿常规，当白细胞转阴时再行停药。在治疗期间要饮食清淡，大量地喝水，不要吃一些偏辛辣的食物。
对男童而言，往往尿路感染由包皮炎所引起，所以如果尿路感染同时合并包皮的红肿，建议外抹红霉素眼膏或者是百多邦软膏。
在儿童尿道感染时，切记不要使用喹诺酮和大环内酯类抗生素，因为这两类抗生素对孩子副作用大一些，尤其是喹诺酮类抗生素会影响骨骼的发育，所以18岁以下的未成年人禁忌使用喹诺酮类抗生素。因此更推荐儿童的尿路感染，使用头孢类的抗生素。
