幽门螺旋杆菌感染可能会引起口臭，但是口臭不一定是由幽门螺旋杆菌引起。口臭有很多原因，包括牙龈病变、牙周病变、口腔黏膜病变等。此外，年轻人分泌功能会紊乱，也会引起口臭，故不能把幽门螺旋杆菌感染和口臭划等号，也不能反过来推论，都属于不正确观点。但是有的患者经幽门螺旋杆菌治疗后口臭症状较轻，后期幽门螺旋杆菌感染不存在，这时检测幽门螺旋杆菌是阴性，但是又出现口臭。这时不主张抗幽门螺旋杆菌治疗，因为幽门螺旋杆菌检测是阴性，这时口臭不单纯是由幽门螺旋杆菌本身引起。