正常肠道既有分泌肠液的功能，也有吸收胃内容物水分的功能，使大便成形。当肠道功能紊乱的时候，包括生理性功能紊乱，以及病理性炎症的时候，会造成肠道的分泌功能以及吸水功能异常，引起腹泻或者便秘。

一段时间内辛辣的东西吃多了，或者情绪比较激动、焦虑或者过度疲劳，会形成功能性腹泻和便秘交替。但是，也有可能是不良疾病，如肠克罗恩病、肠结核、肠肿瘤，也会形成腹泻和便秘交替出现，必须要做肠镜检测，明确病因。