肠重复畸形通常是先天的小儿疾病，一旦确诊肠重复畸形，需要根据肠重复畸形的具体部位，采取不同方式进行手术治疗，具体如下：

1、部分囊肿：部分重复的肠段似囊肿，需要将囊肿段的重复肠段切除，使正常肠段可以蠕动，免除囊肿对正常肠管的压迫；

2、正常肠段：重复肠段与正常肠段完全粘连，需将重复肠段与粘连的正常肠管全部切除，再吻合2个肠管，从而解除压迫、恢复肠管功能；

3、十二指肠段：十二指肠段出现肠重复畸形，因为十二指肠段的壶腹部和其他的中小脏器会分泌特有肠液，所以需要进行内引流，从而减缓十二指肠部位的压力。