大便时出现肛门内疼痛一般是痔疮，以及肛裂、肛周脓肿、肠道炎症导致的。

1、痔疮：急性发作导致痔核充血水肿，引起排便时压迫性疼痛，主要呈现出憋胀性的疼痛。

2、肛裂：疾病处于急性发作期时会出现局部损伤，大便刺激裂口，从而引起该处出现剧烈疼痛，还会伴随有便血。

3、肛周脓肿：此病在急性发作期由于局部皮肤内有明显的红肿，从而也会出现排便时或者非排便期间的肛门局部疼痛，患者的疼痛持续性发作，并且进行性加重，还会伴随肛门局部皮肤温度升高和化脓性感染性症状。

4、肠道炎症：当肠道部位形成炎性改变后，也会引起上述现象，需要进一步通过电子肠镜检查排除肠道炎症性疾病。