阴茎上长小疙瘩的原因有几种可能性，如果阴茎背侧出现轻微的小疙瘩，并且有毛发从上面长出，一般情况下这是正常的毛囊，如果没有红肿、瘙痒的症状，属于正常现象，无需处理。
如果阴茎腹侧出现点状的小疙瘩，通常是皮脂腺，这也是良性的病变，无需处理。但是，如果阴茎的龟头、尿道口或阴茎体出现菜花状肿物，可能是尖锐湿疣，属于性传播疾病，需要到皮肤科或泌尿外科就诊治疗。
如果阴茎的冠状沟处出现串珠状的肿物，可能是阴茎珍珠疹，也属于良性病变，无需处理。如果阴茎的龟头出现无痛的红疹，并且患者有不洁性生活史，需要考虑梅毒的可能性，需要进行针对梅毒的治疗。
如果阴茎的背部或皮肤出现类似痘痘的表现，可能是皮脂腺囊肿，可能需要进行抗感染治疗，必要时可以使用外用红霉素进行治疗。
