碎石手术时会给与麻醉，疼痛感并不明显。但在结石排出的时候，会引起输尿管痉挛性的疼痛，所以在碎石的过程中是有可能发生疼痛的。
　　结石碎石的方法包括体外冲击波碎石、输尿管镜碎石取石术、经皮肾镜碎石取石术等。
　　体外冲击波碎石治疗：直径不超过2cm的肾结石都可以进行体外冲击波碎石。体外冲击波碎石通过X线或超声对结石进行定位，利用高能冲击波聚焦后作用于结石，使结石裂解，直至粉碎成细砂，随尿液排出体外。
　　输尿管镜碎石取石术：包括软镜和硬镜，肾盂或肾脏结石常使用软镜。对于<2cm,透X线，体外冲击波碎石困难的结石，可以选择输尿管软镜下的碎石。经输尿管逆行进入肾盂肾盏，将结石击碎后，再将结石取出体外。
　　经皮肾镜碎石取石术：对于2cm以上的结石，推荐进行经皮肾镜碎石取石术。经皮肾镜碎石取石术在X线或超声定位下，经皮肤、皮下组织到肾皮质，建立穿刺通道，用细针穿刺。建立通道以后，在肾镜下取石或碎石。用超声、激光或者气压弹道等方法，将肾盂内的结石打碎取出。
　　综上所述，在碎石的过程中，有可能发生疼痛的情况，但一般来说都是可以忍受的，碎石之后，一定要多喝水，多排尿，从而促进结石的排出。