根据患有的甲状腺疾病不同，所选择的科室也是不一样的。
　　1、检查甲状腺功能、甲状腺功能亢进、甲状腺功能减退、亚临床甲状腺功能减退症等疾病，或者是女性在备孕期，需检查甲状腺功能水平，这个时候就需要建议去内分泌科进行检查、治疗；
　　2、甲状腺位置不正常、甲状腺内肿物较大，这个时候可能会压迫气管、食道、呼吸困难等，建议患者去外科或者是两腺科进行手术治疗；
　　3、甲状腺癌患者，超过一公分以上者是或突出于甲状腺包膜之外而且还存在其他的并发症，例如可能会有淋巴结转移，建议患者去外科或者是两腺科手术治疗。
　　4、如果是甲状腺术后出现问题，也需要挂外科或者是两腺科进行检查。
　　5、检查甲状腺超声是不需要空腹的，但是脖子上不能带有饰品，这样有时候会对探头造成影响。如果是检查甲状腺功能这个一般是需要空腹的。
　　每个医院的科室分布不一，选择科室也是不一样的，具体以每个医院的情况为准。