怀孕三个月肚皮痒可能是过敏、感染、糖尿病等原因所致，根据病因不同，治疗方法也不相同：

1、妊娠期痒疹：由于孕期体内激素水平发生变化，自身免疫功能也与孕前有所不同，孕妇的皮肤较为敏感，可能会出现妊娠期痒疹。孕妇不可擅自用药，应在医生指导下进行对症治疗；

2、妊娠期糖尿病：如果孕期血糖升高，刺激末梢神经，孕妇也可能会出现肚皮痒的情况，应及时就医，控制体内血糖水平；

3、感染：如果孕妇肚皮感染了真菌，可能会出现体癣，肚皮瘙痒较为严重，同时可伴有红肿、疼痛、脱屑等症状，应及时到皮肤科就诊，进行抗真菌治疗；

4、荨麻疹：如果在孕期接触了易致敏的食物或物品，导致孕妇患上荨麻疹，也可能出现肚皮痒的情况，应立即远离致敏物质。

除了上述治疗，孕妇应尽量穿着棉质衣物，保持皮肤卫生清洁，少吃辛辣刺激性食物，以及会导致过敏的食物。