由于灰指甲是真菌感染所致，因此如果没有及时进行治疗，病情严重后会有较多不良后果，常见如下：

1、全甲毁损：灰指甲病情严重后会进展为全甲毁损型灰指甲，表现为整个甲板被破坏，呈灰黄色或灰褐色，继而甲板部分或全部脱落，甲板表面残留粗糙角化堆积物，严重影响美观，可导致患者产生自卑情绪而造成社交障碍。除此之外，还可能会影响手部或者脚部的精细动作和功能，导致正常生活和工作受限；

2、传染：灰指甲具有很强的传染性，家人、朋友会因接触而感染。病甲也可能会将真菌传染至自身其他部位，导致手癣、体癣、股癣等；

3、并发症：灰指甲病情严重的患者，患指容易继发细菌感染，引发甲沟炎、甲床炎等并发症，甚至引起丹毒、蜂窝织炎，造成患处红肿、化脓以及剧烈疼痛。