支原体和衣原体都是介于病毒和细菌之间的病原微生物。支原体和衣原体感染易引发呼吸系统症状，还可感染眼部和泌尿生殖系统，可能出现咽痛、干咳、结膜充血、尿急、尿痛等症状。由于感染部位及感染的支原体、衣原体不同，临床症状也存在一定差异。

1、呼吸道症状：如果是肺炎支原体或鹦鹉热衣原体引起的感染，通常会侵犯呼吸道，可以引起上呼吸道或下呼吸道的感染，患者通常表现为发热，伴有咽痛以及刺激性干咳的症状；

2、眼部症状：如果是沙眼衣原体引起眼部感染，可以导致沙眼，表现为结膜充血、流泪，睑结膜可见滤泡，可伴有脓性分泌物，通常患者会有眼睛异物感；

3、泌尿生殖系统症状：如果是泌尿生殖道的支原体、衣原体感染，如解脲支原体、人型支原体及沙眼支原体引起的感染，由于感染部位、性别不同，患者可出现不同的临床表现。如果是局限在泌尿系统的感染，患者可以出现尿频、尿急、尿疼、排尿困难或排尿不尽感，会有尿道脓性分泌物，尿道口红肿的症状。此外，男性患者还可以引起睾丸炎，表现为睾丸疼痛以及阴囊的肿胀。女性患者可引起阴道炎、宫颈炎、输尿管炎症，如果引起了宫颈或阴道炎症，会有白带增多、有异味。如果引起盆腔炎症，可以出现下腹部或附件区的隐痛、压痛；

4、其他症状：对于衣原体感染，有些患者还可以表现为局部腹股沟淋巴结肿大。如果病程迁延可以引起局部淋巴结破溃、溃疡，形成瘘管。