瘘管可分为先天性和后天性瘘管，后天性瘘管常见，如腹腔内瘘管、肛瘘等，先天性瘘管如甲状舌骨瘘，不同情况治疗方法不同，一般治疗后可有较好的效果。
1、先天性瘘管：如甲状舌骨瘘是由于先天发育缺陷导致的。应用非手术治疗方法不能治愈，以手术切除为首选，术中可借助探针引导切除全部瘘管。当舌骨上至舌盲孔间瘘管无法辨别时，可做舌肌的柱状切除。急性感染时应先控制炎症，再行手术治疗；
2、腹腔内瘘管：如肠瘘、胆瘘等，是由手术、创伤、腹腔感染等导致，主要发生在腹部手术后，应进一步选择剖腹探查行窦道切除，术后可给予负压吸引清除腹腔内分泌物，注意维持水和电解质平衡，适当应用抗生素抗感染，一般治疗效果较好；
3、肛瘘：是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变，患者可在医生指导下使用抗生素治疗，也可局部用中药药液或高锰酸钾洗液温水坐浴，配合外敷抗菌软膏治疗，还可应用肛瘘切开术切开瘘管，促进引流通畅，另外还可选择使用挂线疗法，能适当保护肛门功能、减少肛门失禁。
