早上起床后口苦、口臭、唾液混浊发黄，首先应该考虑与口腔卫生不良有关，患者长期吸烟、不刷牙、多食肥甘厚味之品，导致口腔内异味及细菌滋生。建议注意口腔卫生，及时进行刷牙，即可缓解症状。此外胃食管反流、胆囊炎等多种原因也可导致上述症状，具体情况需要就医明确诊断，下面讲一些常见的可能原因。

1、胃食管反流：是一种由胃十二指肠内容物反流入食管引起不适症状和并发症的疾病，典型症状为反流和烧心，当反流发生时可伴有口苦、口臭等症状。患者可使用抗酸药和促胃动力药进行治疗，比如奥美拉唑、多潘立酮、莫沙必利等；

2、胆囊炎：胆囊炎属于胆囊结石的并发症，可表现为腹部不适，饱胀、嗳气、呃逆等，当出现呕吐时，可表现为口苦、口臭、唾液混浊发黄等。建议出现症状后，及时进行腹部超声检查，以明确诊断。

此外，中医认为肝胆湿热也可造成口腔出现上述表现。典型症状为口苦、口腔异味、食欲不佳、便秘等。建议可服用一些清热利湿、疏肝利胆的中药，比如龙胆草、黄芩、木通、当归等。具体用量以及药物配伍还需要中医医生诊治后，才能明确。