水蛭是一味中药，具有活血、散瘀、通经的作用，主要用于治疗血瘀导致的疾病。而水蛭素是水蛭唾液腺中的提取物，现代药理研究表明，水蛭素针对于血栓具有一定的治疗作用，也可以对抑制血栓生成有所帮助。

血栓的形成主要是凝血酶水解蛋白后引起一系列复杂的变化，最终引起凝血，导致血栓的形成。而水蛭素可以与凝血酶结合，从而可以防止血栓的形成与发展，水蛭素还被作为用于治疗弥散性血管内凝血症的有效药物成分之一进行使用。由于水蛭素可以起到抗凝血、抗血栓的作用，因此被广泛应用于静脉血栓、脑血栓等存在血栓疾病的治疗之中。

虽然水蛭素自身结构的稳定性较强，且易于与凝血酶分子相结合，但水蛭素仍然存在部分副作用，比如长期大量使用，患者出现轻微出血的情况，也有少部分患者会出现过敏。因此使用时建议与肝素、阿司匹林等传统的抗凝药物联合使用，同时注意体弱人群、孕妇、月经期女性禁用。