检查喉咙时喉镜和CT都可以帮助医生进行临床诊断，但是具体使用哪一种检查项目，要根据疾病种类或疾病侧重观察的方向来进行选择，两者不能完全的相互替代。
喉镜检查是具有诊断和治疗两种作用的检查项目，对于咽喉部病变等都可以进行喉镜直观检查。喉镜检查可以直观的观察到黏膜表面或病变部位表面是否存在红肿、分泌物，有无肿瘤生长，肿瘤的形状、大小以及与周围组织间的关系。同时可以对病变部位进行病理取样，为后期病理化验提供便捷。检查前需注意禁水，以免检查过程中由于刺激导致咳嗽、呕吐，造成误吸。
CT检查是非入侵性的，主要是解剖横断面分析病变的性质，可以看出检查部位的各个层次面以及咽喉部软组织深部的病变情况，例如患者出现喉部肿瘤性的病变，可以查看病变部位与周围的关系，判断是否侵犯重要脏器。患者进行检查时要注意，CT检查存在有一定的辐射性，对于备孕期或者妊娠期女性要慎重选择。
可见喉镜及CT各有优点，如需检查喉咙，可在医生指导下根据自身病情，选择合适的检查方式进行诊断及治疗，不要自行盲目选择。